行政事业单位实行会计集中核算后，普遍存在单位重资金使用不重财务管理，会计核算中心注重核算而缺少监督的状况。随着公共财政、国库支付等改革措施的推进，部门预算资金的增加，对行政事业单位的财务管理要求大大提高。因此，笔者认为，当前行政事业单位在会计核算具体事务减轻的情况下，要将财会工作的重点放在内部财务管理方面。
　　笔者认为，行政事业单位加强内部财务管理工作，首先要根据《会计法》等法规制度，制定出符合本单位业务开展的管理制度。同时，在制度中体现以下两项原则：
　　1.适应性、可操作性原则。适应性是一项制度的生命。制度的制定必须结合单位实际，不能照搬硬抄《会计法》《行政事业单位会计制度》，或其他单位的管理方法和管理模式，要与单位其他管理制度相衔接。内部财务制度的条文在表述上应尽量通俗易懂，操作方便，并与日常会计核算的实务紧密联系；要按单位实际对有关内容、程序、权限等作出明确规定，使单位会计流程中的各个环节都有章可循、规范有序。
　　2.监督性原则。对每项重要经济业务都要安排事前、事中、事后的控制方式，便于及时掌握和归集所需要的信息。对会计账目列示方式、财务报告的披露方式要进行具体详尽地规定，如单位财产盘亏或盘盈、重大资产处置、对外投资等事项财务处理前，必须履行的审批手续，需要的支持文件等。必要时可设置固定资产、在建工程等资本性支出项目内部科目，与下属单位建立起对应关系，使下属单位的资本性支出项目支出始终受到有效监督。
　　其次，要严格执行制度，在制度的约束下，有明确的工作重点和工作程序：
　　1.重视部门预算管理，强化资金使用的计划性。部门预算编制在有关科室的配合下，应着重对行政事业单位收费、房产租赁等非税收入、单位专项工作支出等进行详尽、细化的预算，编制年度预算方案，提交单位领导同意后，作为资金管理的依据。
　　2.在坚持“一支笔”审批的基础上，重大支出实行集体决策程序。应着重明确有关接待费、差旅费、会议费等控制标准，以及超支审批程序。对各种设备、资产的修理维护及其它大额支出事前应有预算，领导审批后财务作控制依据。
　　3.按规定进行政府采购的基础上，着重对较大用量办公用品、福利物品及其它物资等明确采购程序，选择供应商需进行询价竞标，并实行入库验收管理、出库领用登记制度。
　　4.固定资产管理着重要对单位价值、购置签批、处置报批、年度清查等环节明确标准或操作程序，并指定科室负责资产的日常集中管理工作。
　　5.根据内部会计控制“不相容职务相分离”的原则，分设岗位，做到不相容职务互相控制。
　　再次，在加强财务管理中应注意处理好几个关系：
　　1.领导重视与制度实施的关系。制定制度是加强管理的需要，制度实施的效果与领导重视是分不开的。因此，制度在制定前，要取得领导的充分理解和支持；制定中，要从单位整体管理的角度考虑问题，而不是以方便财务工作为前提；制定后，要加强监督，保证制度实施的效果。碰到制度在实施过程中与实际情况发生矛盾时，及时反馈领导，进行灵活处理，并相应修订制度的不合理之处。
　　2.单位与会计核算中心的关系。各单位作为会计主体，在会计集中核算后，财务管理的职能仍然不变，按照实际合法合理地筹集、分配、使用资金的权力仍在各单位自身，不能认为已实行会计集中核算，有没有财务管理制度就不重要了。会计核算中心作为会计信息的处理、监控和披露中心，单位应与其加强联系注意有关经济事项事前、事后情况的衔接，共同促进财务管理水平的提高。
　　3.程序与管理成本的关系。任何一项制度都是通过一定的程序建立的，不能因强调程序而不考虑单位实际情况，如人员、机构、经费等，一味增加管理成本。要根据“必须、有效、简明、和谐”的要求，把握好程序与管理成本的关系，提高单位财务管理制度的实效性。